genetika

Génové čipy

 

DNA mikroarrays:

§         Priemer nanesených vzoriek je menší ako 200 mikrónov

§         Mikroarray – mikroskopické sklíčko s cDNA sekvenciami (500 – 5000 bp) alebo syntetickými oligonukleotidami (20 – 80 nukleotidov)

§         Fluorescentne zančená cDNA sa viaže k spotom obsahujúcim homologické sekvencie

§         Intenzita fluorescencie každého spotu = expresia génu reprezentovaného v spote (spot – velkost nanesených vzoriek DNA)

§         Využitie:

ü      Simultánna anylýza tisícok génov

ü      Štúdium expresie génov v určitom čase, pletive, atď.

ü      Umožňuje anlyzovať až 1000 vzoriek naraz

DNA čipy:

ü      Technika DNA čipov umožňuje analýzy a porovnávanie celých genómov

ü      Státisíce rôznych fragmentov DNA (cDNA, PCR fragmenty) sú prichytené na chemicky opracované sklíčko, a môžu byť naraz hybridizované k dvom rôznym vzorkám RNA, napríklad z kontrolnej a stresovanej rastliny

ü      V tomto prípade sú vzorky z kontrolnej resp. stresovanej rastliny označené rozdielnymi fluorescenčnými farbičkami (červenou a zelenou)

ü      Po hybridizácii a nasnímaní sklíčka sa detekujú gény, ktoré sa exprimujú len v kontrolnej rastline (červené hybridizačné body), len v stresovanej rastline (zelené hybridizačné body) alebo v oboch typoch rastlín (žlté hybridizačné body ako výsledok prekrytia zelenej a červenej fluorescencie oboch vzoriek)

<span style="font-size:12.0pt;font-family:" times="" new="" roman";="" "times="" ar-sa"="">Technika je veľmi finančne náročná, uplatňuje sa v lekárskej diagnostike, analýze stresových reakcií, genomike a podobne