Sekvencie DNA
NUKLEOTIDOVÁ SEKVENCIA DNA PRI EUKARYOTOCH
1. OPAKUJÚCE SA SEKVENCIE NUKLEOTIDOV
a) Mnohonásobne sa opakujúce ( satelitové ) sekvencie nukleotidov: krátke úseky DNA o dĺžke max. 10 nukleotidov, ktoré sa môžu opakovať až miliónkrát. Predstavujú okolo 10% z celkového genómu
b) Stredne sa opakujúce sekvencie nukleotidov: opakujú sa okolo tisíckrát. Predstavujú 20% z celkovej dĺžky DNA
c) Neopakujúce sa ( jedinečné alebo singulárne ) sekvencie nukleotidov: v celej dĺžke DNA sa nachádzajú len jedenkrát a tvoria 70% z eukaryotického genómu
2. PALINDRÓMY
Sú to úseky DNA, v ktorých sú identické alebo takmer identické sekvencie v opačných smeroch na komplementárnych vláknach DNA.
Typy:
a) Krátke palindrómy ( dĺžka 3-10 bp )
b) Dlhé palindrómy ( dĺžka nad 10 bp ): vytvárajú vlásenkové štruktúry, ktoré stabilizujú komplex DNA/RNA
3. OPAKUJÚCE SA SKUPINY GÉNOV
Sú to skupiny génov, ktoré chránia DNA pred mutáciou. Sú to 3 skupiny, ktoré kódujú:
a) rRNA
b) tRNA
c) bielkoviny u bezstavovcov
4. INTRÓNY A EXÓNY
Eukaryotická DNA má intrón-exónovú štruktúru
a) Intróny sú úseky DNA, ktoré nemajú kódovací zmysel, to zn., že nekódujú žiadnu AMK sekvenciu polypeptidového produktu
b) Exóny sú úseky DNA, ktoré majú kódovací zmysel, to zn., že kódujú určitú AMK sekvenciu polypeptidového produktu
Intrón-exónová sekvencia sa prepisuje do prekurzora mRNA a v procese jej „zrenia“ sa intróny vyštiepujú
5. MEDZERNÍKY ( SPACERS )
Sú to nekódujúce sekvencie , ktoré oddeľujú od seba gény alebo skupiny génov pre rRNA a históny.
Existujú 2 typy:
a) Prepisované do pre-rRNA alebo do hnRNA, ktoré sa v priebehu sceľovacích procesov vyštiepujú a v zrelých molekulách rRNA alebo mRNA sa nevyskyujú
b) Neprepisované do pre-rRNA alebo hnRNA
