Metódy zostavovanie karyotypov

Metódy zostavovanie karyotypov

   Konvenčná

n    hospodárske zvieratá

n    rozdelenie chromozómov do štyroch skupín podľa tvaru (metacentrický...)

n    v rámci skupiny usporiadané podľa veľkosti od najväčšieho po najmenší

    Denverská

n     človek

n     rozdelenie do skupín:

n    A – najväčšie metacentrické (3 páry)

n    B - najväčšie submetacentrické (2 páry)

n    C – stredne veľké submetacentrické (7 párov)

n    D – akrocentrické (3 páry)

n    E – malé submetacentrické (3 páry)

n    F – najmenšie metacentrické (2 páry)

n    G – jeden akrocentrický a jeden telocentrický

n    pohlavné chromozómy

   Farbenie karyotypu:

n     klasické celoplošné farbenie

n     selektívne farbenie:

n    koncových časti: identifikácia zlomov a strát počtu koncových úsekov

n    chromatíd: identifikácia blokovania crossing-overov

n    centromér: identifikácia blokovania procesov

Prúžkovacie metódy

n      využíva sa rozdielna reakcia heterochromatínu a euchromatínu na zásadité farbivá

n      použitie farbív, ktoré sa viažu na špecifické časti chromozómu

n      rozdelenie chromozómov na prúžky

n      poloha a počet prúžkov pre daný chromozóm daného druhu špecifický

n     typy:

n    G – giemsovo farbivo

n    R – vznik opačných prúžkov ako pri G

n    Q – farbenie centroméry

n    C – farbenie herterochromatínu

Metódy molekulárnej cytogenetiky

n     využitie metód hybridizácie in situ

   Fluorescenčná hybridizácia in situ (FISH)

n     použitie sondy: jednoreťazcová DNA značená fluorescenčne, komplementárna k určitej oblasti príslušného chromozómu

n     detekcia hybridov fluorescenčným mikroskopom

n     význam:                                           stanovenie poradia génov na chromozóme                                         (detekcia chromozómových aberácií)

Význam konštrukcie karyotypu

n     detekcia genómových mutácií

n    karyotypy (konvenčná, denverská)

n    klasické celoplošné farbenie

n     detekcia chromozómových aberácií

n    selektívne farbenie

n    prúžkovacie metódy

n    FISH

FOREX